1997年首次为国家队登场，是目前丹麦国家队中的头号射手。2002世界杯前效力费耶诺德的托马森便在欧洲联盟杯赛场上一鸣惊人，而后韩日世界杯赛场小组赛中威风八面一度排名射手榜首位。转会AC米兰之后，尽管托马森在第一个赛季大多时间内替补登场，但在03-04赛季中他成为了米兰队中破门效率最高的射手。2005年7月16日托马森离开AC米兰队加盟德国斯图加特队效力。